この記事は whywaita Advent Calendar 2023 の23日目です。 皆さんは whywaita Advent Calendar とは何かご存じでしょうか？私はよくわからないまま参加しています。whywaitaらしき人物に事情を伺うと 2019年のほうれん草に関する記事 のURLを貼られて、さら…

前回のCKA取得RTAの記事で「今の転職活動の役に立てたくて～」みたいな話を書いていましたが、実は記事を書いて1週間くらいで無事に転職活動が終わっていて、2022年7月頃から株式会社サイバーエージェントに入社してインフラエンジニアをやっていました。 転…

N年振りのブログ記事の執筆ですが、実質1ヶ月くらいでCertified Kubernetes Administrator (CKA)を取得できたので、先人に倣って適当に記録を書こうと思います。 Kubernetes完全に理解した pic.twitter.com/yqBmboipWE— meta (@meta1127) 2022年5月6日

時間に余裕があるときに見直すための、コンテナ関連のセッションに関する個人的なメモ。（適宜更新） 追記 各セッションの発表やQAの配信内容をあとから見るには、基本的にSC20のレジストレーション（有料）が必要であるように見える。外部サイトに論文やプ…

はじめに SC19のプログラムのコンテナに関連するセッションの個人的な備忘録というかメモというか。 一部（Tutorial関連）は参加していないが、オンライン上の資料があったので軽く目を通したときのめも。 雑なメモなのであまり推敲などしていない SC19プロ…

2018年7月2日に開催されたHPC OPS研究会に参加してきました。初回は見逃してしまって参加できなかったので今回が初参加なのですが、折角なので簡単なレポートを残しておきます。 HPC OPS研究会は、科学者の研究効率を最大化するためにコンテナ仮想化やクラウ…

2018年6月に沖縄科学技術大学院大学（OIST）で開催された第54回バイオ情報学研究会（SIGBIO）の研究会にて口頭発表を行いました。 第54回バイオ情報学研究会（SIGBIO 54） 場所：沖縄科学技術大学院大学（OIST: Okinawa Institute of Science and Technology…

タイトル "Is Singularity-based Container Technology Ready for Running MPI Applications on HPC Clouds?" 著者 Jie Zhang, Xiaoyi Lu, Dhabaleswar K. Panda from Network-Based Computing Laboratory, The Ohio State University Network-Based Computi…

前回の記事で紹介した3ヶ月のスイスのCSCS滞在中にHPC運用チームで取り組んだ成果が、無事に同機関のスーパーコンピュータPizDaintの本番環境上で利用可能になったようです。 metavariable.hatenablog.com はじめは期間が長いと思っていたインターンも、作業…

昨年2017年秋～冬にかけて経験した3ヶ月ほど滞在したスイスのCSCSで行った海外留学について書いてみます。ほとんど研究内容には触れず、かなり一般的な話です。タイトルにある通り、研究というよりもただの感想です。 海外留学の概要 滞在場所 Lugano, Switz…

個人的なまとめ 小電力効率GREEN500で東工大TSUBAME3.0が首位にランクイン LINPACK性能TOP500首位は相変わらず中国Sunway Taihulight 3位にスイスCSCSのPiz Daint バイオインフォ関係のセッションが結構多い（初日Keynote, Session, Workshop, …） LinuxCont…

タイトル Reproducibility of computational workflows is automated using continuous analysis 著者 Brett K Beaulieu-Jones, Casey S Greene Perelman School of Medicine, University of Pennsylvania 掲載情報 Nature Biotechnology, vol.35, No.4, pp.…

2017年3月23日に北陸先端大学（JAIST: Japan Advanced Institute of Science and Technology）で開催された、第49回情報処理学会 バイオ情報学研究会(SIG BIO 49)に参加して研究報告をしてきました。 タイトル 『コンテナ型仮想化による分散計算環境における…

Speaker Deck speakerdeck.com なにこれ 研究室でDockerの使い方を布教したときのスライドです。 ゆるふわに「とりあえずどんな感じで使えるのかわかればいいや」という感じの内容です。 なんでそんなことを 個人が使う場合でも便利なツールだから 研究領域…

タイトル An Updated Performance Comparison of Virtual Machines and Linux Containers 著者 Wes Felter ♰ , Alexandre Ferreira ♰ , Ram Rajamony ♰ and Juan Rubio ♰ ♰ IBM Research Division, Austin Research Laboratory 発表媒体 IBM Research Report…

数か月前からちまちまDockerを調べては触ってきたのだけれど、そろそろ情報がまとまった書籍を元に知識を整理したくなったので読んでみた。 プログラマのためのDocker教科書 インフラの基礎知識&コードによる環境構築の自動化作者: 阿佐志保,山田祥寛出版社/…

DockerでSherif-Judgeを構築する記事をQiitaに書いて、あとGitHubで公開しておきました。 github.com qiita.com

ソルトレイクシティで開催されたSC16に参加してきました。めっちゃ楽しかったです。 ただ、初SCで事前知識がなく、現地についてからも混乱していたため、備忘録的にメモを残しておく。（セッション内容はまた別に） SC16の概要 期間：2016年11月12日（土）～…

ラボの計算機がちょろっと古いLinuxOSで「dockerを入れようにもまずカーネルアップグレードの必要があって、そもそもOSのアップグレードは何処で断ち切れていて、じゃあ何処のノードなら依存関係なくて安全で…」という問題の根本原因を調査していたとき、以…

調べてたら2012年頃からIBM内部の公開議論板？みたいなのが引っかかったりしてた。 Using Docker in High PerformanceComputing in OpenPOWER Environmenthttps://t.co/Ms5sKh8vDq— メタ (@Meta1127) 2016年10月19日 docker.openmpi : A scalable OpenMPI ru…

人間というハードウェアと、意識というソフトウェアについて考える時に、いつもこの本を引用したくなる。 脳のなかの幽霊 (角川文庫)作者: Ｖ・Ｓ・ラマチャンドラン,サンドラ・ブレイクスリー,山下 篤子出版社/メーカー: 角川書店(角川グループパブリッシン…

以下のURLを読んでいて気になった論文をピックアップ techblog.yahoo.co.jp MapReduce: Simplified Data Processing on Large Clusters http://research.google.com/archive/mapreduce.html PDF Google Hive - A Warehousing Solution Over a Map-Reduce Fra…